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中国科学院上海植物逆境生物学研究中心专家报告(二)

报告题目:植物中的表观遗传学

人:郎曌博 研究员

报告时间:20171202日上午1000

    点:生科楼E2004

      中国科学院上海植物逆境生物学研究中心研究员。2014年获美国普渡大学 (Purdue University) 博士学位,2014.12-2016.09在普渡大学园艺和景观设计系 (Department of Horticulture and Landscape ArchitecturePurdue University) 从事博士后研究。201610月起任职中国科学院上海植物逆境生物学研究中心(全职)。

   郎曌博研究组以番茄为研究对象,结合遗传学,生物信息学,分子生物学等多种研究手段来研究DNA甲基化对果实成熟的调控机制。相比较最常用的模式植物拟南芥,在番茄中进行DNA甲基化机制的研究有其优势及独特性。之前的研究表明,DNA去甲基化在拟南芥中对胚胎中基因印记十分重要,然而在成熟的植物体中,DNA去甲基化主要作用于转座子及基因间区域,很少影响编码基因的表达。在番茄的果实中,已有证据显示,DNA去甲基化有可能参与了大量的与果实成熟相关的基因表达。因此,以番茄为研究对象,能揭示DNA去甲基化对植物基因表达和生长发育的重要功能。

近年代表论文:

Lang Z. #,  Wang Y., Tang K., Tang D., Datsenka T., Cheng J., Zhang Y., Handa A., Zhu J-K #. (2017) Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of ripening-repressed genes in tomato fruit. Proceedings of the National Academy of Science. 25, P201705233. (# Co-corresponding author)

Tang K.*, Lang Z.*, #,  Heng Zhang, Zhu J.-K. (2016) The DNA demethylase ROS1 targets genomic regions with distinct chromatin modifications. Nature Plants, 2(11): 16169. (*equal contribution, #corresponding author).

Zhang Q.*, Wang D.*, Lang Z.*, He L., Yang. L, Zeng L., Li Y., Zhao C., Huang H., Zhang H., Zhang H., Zhu J.-K. (2016) The RNA-directed DNA methylation pathway mediates wide spread DNA methylation interactions in Arabidopsis hybrids. Proceedings of the National Academy of Science 113 (29), E4248-56 (*equal contribution).

Wan Y., Tang K., Zhang D., Xie S., Zhu X., Wang Z., Lang Z.*  (2015) Transcriptome-wide high-throughput deep m6A-seq reveals unique differential m6A methylation patterns between three organs in Arabidopsis thaliana. Genome Biology 16 (1), 1-26 (*Corresponding author)